巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以会复发。在术后如果没有计划怀孕的情况下，可以治疗3个月到半年的时间，主要是避免复发。对于计划怀孕的病人尽快怀孕，避免引起复发。