尽快手术治疗。手术治疗之后可以考虑应用一些预防短期内复发可能有一定的帮助作用的药物，来预防短期内复发可能有一定的帮助作用。但是对于反复发生的巧克力囊肿的病人，目前医学没有太好的办法，如果有生育要求，也可以考虑行巧克力囊肿的穿刺手术。