尿路感染是由多种因素引起的，与病原菌的毒性及人体抵抗力有关。
第一，尿路本身的因素：结石、异物、肿瘤等医疗操作后，如留置导尿管、输尿管、支架管等，会导致膀胱、尿道粘膜防御能力下降，有利于细菌的定植和侵染；
第二，尿路梗阻：尿路梗阻的原因有很多，如前列腺引起的尿道梗阻、结石、肿瘤引起的输尿管、膀胱梗阻等，尿液不能完全排空，滞留在体内，引起细菌感染；
第三，神经系统损害：如广泛的盆腔手术和妇科手术，造成广泛的尿路肌群和排空功能神经系统的损害，导致排尿困难，进而导致感染。
当然，这也和人体的抵抗力有关，在免疫力正常的情况下，细菌可以在一定程度上抵抗细菌感染，但是当各种原因导致免疫力下降时，细菌很容易在泌尿道中定植，从而导致泌尿系统感染。