引起男性尿道炎致病微生物种类繁多，按致病微生物，选用针对性用药，能取得最佳治疗效果。
1、淋球菌感染所致急性淋菌性尿道炎俗称淋病，选择头孢类药物是最有效的；
2、衣原体，支原体感染引起非淋菌性尿道炎等，选择左氧氟沙星，克拉霉素，阿奇霉素、其中以多西环素及其他疗法疗效最佳；
3、霉菌感染所致男性尿道炎选择伊曲康唑之类；
4、对滴虫感染所致尿道炎选择甲硝唑和替硝唑疗效最佳。