不同的尿道炎病人感染的细菌种类也不尽相同。病因的增加、毒力的增强、患者自身免疫能力的降低都是导致的。
一、非特异性尿道炎
主要的致病因子有大肠杆菌、葡萄球菌、链球菌等。
二、特异性尿道炎，
1.淋菌性尿道炎：主要侵犯泌尿系和生殖系的粘膜，主要是淋病奈瑟菌。淋病奈瑟菌是人类惟一的自然寄生体，具有一定的易感性，一旦发生疾病，机体免疫功能下降，很容易再次感染。淋菌性尿道炎是通过性接触来传染的，偶尔可以通过衣裤、毛巾、浴盆、便盆和手来传染。产妇在分娩过程中感染淋病是导致新生儿感染的主要因素。
2.非淋菌性尿道炎：主要是由沙眼衣原体或支原体引起的，另外还包括滴虫、单纯疱疹病毒、肝炎病毒、白色念珠菌、包皮杆菌等。通过性接触传染。