肾结石术后并发症主要有以下几种：
1.感染：尿路感染主要表现为发热、腰痛等，若是尿液中有脓细胞，尿培养中存在细菌时，应同时进行药敏试验。
2.损伤部位：结石体积小，活动度高，局部组织损伤较轻，但较大且固定的鹿角状结石会导致肾盏、肾盂上皮细胞脱落，出现溃疡、纤维组织增生、中性粒细胞及淋巴细胞浸润，从而导致纤维化。
3.尿路梗阻：肾结石在泌尿系管腔内阻塞可导致梗阻部位以上积水。
4.脂肪组织替代肾脏组织：肾结石肾盂肾炎时，肾组织萎缩，可由脂肪组织替代。肾脏保持原状，但总体上缩小。肾包膜粘附于肾表面，肾组织萎缩，硬化。严重的肾组织很少甚至完全消失。