肾结石的处理原则主要是一旦形成梗阻，就应该进行积极的治疗。
如无梗阻肾结石形成，可临时观察，定期复查。在检查之前要做好充分的准备工作，包括患者本身以及家属都需要有良好的配合和沟通能力。一旦梗阻形成，应积极处理，由于梗阻形成后，若梗阻不能及时消除，肾结石可导致较严重肾积水，对于肾脏功能的损害则更为严重。另外在临床上发现有部分患者出现了尿路症状，但是这些患者并不是肾功能不全或者尿毒症，而是一种比较罕见的情况，叫做肾性高血压，也称为原发性高血压病。若持续时间较长，此种伤害可能越大，损害肾脏常不可逆转，再次采用手术及其他方法处理。