其主要病因可能是病原体感染、炎症和异常的盆底神经肌肉活动等的共同作用。临床某些以慢性炎症为主、反复发作或加重的无菌性前列腺炎，可能与厌氧菌及细菌变异为L型有关。沙眼衣原体、支原体、寄生虫、真菌、病毒、滴虫、结核分枝杆菌等也可能是该型的重要致病因素。