但尿激酶胸腔注射可引起出血，引起出血可能是由于注射时扎破胸壁大血管如肋间动脉或胸廓内动脉所致。也有可能是尿激酶的作用，注射损伤处不能形成有效血栓止血引起。尿激酶胸腔注射还可以引起胸腔感染，如果注射时不严格按照无菌操作很容易造成胸腔感染，引起脓胸。