少精子症本身无明显症状，往往是因婚后夫妇不育就医而被发现。当有引致精子数量减少的相关疾病存在时，可出现相关的症状。如精索静脉曲张时可有阴囊坠胀；前列腺炎时可见尿余沥不尽，腰骶部坠胀等；精囊炎时可见血精；睾丸炎时睾丸疼痛等症状。