生理性尿分叉，主要是由于尿道或尿道开口处临时有阻塞，男性射精后因部分精液还残存在尿道中，海绵体充血尚未完全消失，导致尿流不畅。病理性尿分叉是经常的或长期的排尿分叉，很可能与一些疾病相关。长期尿分叉大多由于后尿道或尿道口处狭窄，或因慢性炎症后形成瘢痕，导致尿液不能通畅排出。急性尿道炎、前列腺炎期间，由于尿道充血、肿胀、分泌物增多，可影响尿流的通畅而出现分叉现象。