女性衣原体阳性表明体内存在衣原体感染。衣原体是一种病原体，是介于病毒和细菌之间的病原微生物。机体感染衣原体以后，可以引起衣原体感染疾病的发生。在临床上比较多见的有衣原体肺炎，以及衣原体阴道炎、尿道炎和皮肤的感染，以及眼部的感染。