输尿管囊肿指的是膀胱内黏膜下输尿管的囊性扩张，主要是与胚胎发育有一定关系。在胚胎发育的过程中，输尿管和尿生殖窦之间的隔膜破裂或者被吸收，就会形成输尿管口。但是在某些特殊情况下隔膜没有被吸收，或者是没有自发破裂却继续存在，就会导致输尿管闭锁或狭窄，尿流排泄不畅或者受阻，导致输尿管内的压力增高，所以就会形成输尿管囊肿。