男性尿分叉常见的危害有反复发作性尿道炎者，长时间后部分尿道内膜组织形成瘢痕，致使局部尿道狭窄造成排尿不畅。还有是急性尿道炎、前列腺炎期间，由于尿道充血、肿胀、分泌物增多，也可影响尿液的通畅而出现分叉现象。如果不及时治疗，可能会导致早泄的现象，而且会使人出现腰酸背痛的情况。