阴茎水肿是否会自愈，主要看引起阴茎水肿的原因是什么，然后才能判断是否会自愈。如果是包皮手术导致的水肿，随着病情的恢复，一般会自愈。如果是炎症感染引起的水肿，需要积极的应用抗生素治疗，这样水肿才可以恢复。如果是外伤导致的水肿，当外伤恢复之后，水肿也会恢复。