肾结石最重要、最严重的并发症是疼痛，从轻微疼痛、胀痛到肾绞痛，绞痛意味着剧烈疼痛、满头大汗、疼痛难忍。其治疗根据症状严重程度决定，甚至需要手术、止痛药、输液利尿，甚至经过内腔镜碎石缓解疼痛。肾结石还有一个并发症为泌尿系感染高烧，也需要即刻用抗炎治疗。