引起男性精子畸形的原因有泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等，们均可影响男性精子的质量；使用激素或某些化学药物，如抗癌药等，可使精子发育不成熟；生殖腺受到放射线照射，可引起精子的突变；阴囊局部长期高热、长期酗酒（特别是高浓度的烈性酒），均可使精子发生畸变。