怀孕三个月流出褐色分泌物是由于以下原因导致的。
如果怀孕三个月流出褐色分泌物，可能是由于胎盘较低或过度劳累，熬夜引起现状流产导致的。也有可能是性接触后，宫颈糜烂或宫颈息肉导致的是需要及时去往医院进行详细的检查，在医生的指导下进行保胎治疗。
建议患者在日常生活中，避免剧烈运动，在医生的指导下使用药物治疗，避免对胎儿产生影响。