怀孕初期流褐色分泌物是否会胎停育，需要根据实际情况来判断。
怀孕初期，如果胎儿发生胚胎发育不良的情况，会导致底部蜕膜出血，但是出血量并不多，而且是棕色的。如果黄体功能不全，可以口服黄体酮胶囊、地屈孕酮片、黄体酮胶囊等，多注意休息不要有事。如果没有流血，没有棕色的排泄物，HCG翻番，超声波显示胎儿还活着。如果棕色的排泄物继续增加，持续的时间越久，就会导致出血增加，并且会伴随着下腹部的疼痛，血液HCG和黄体酮都没有升高，如果B超显示胎儿的生长状况并不符合怀孕周期，那么就会导致胎停育。