胎儿肾结石脑积水主要是由于钙盐在肾内沉积，具体原因可能和妈妈在孕期饮食有关，和接受某些药物的化学刺激有关等。
另外在妊娠过程中如果没有进行必要的治疗，很容易造成胎儿发生畸形或者其疾病。脑积水属脑发育不良，还与孕期受到某些刺激有一定关系。因为孕妇本身就患有高血压和心脏病，所以在孕期会受到各种不良因素的影响，从而使胎儿大脑产生了畸形，进而引发严重的脑部病变。基因不正常还会导致大脑发育问题和脑积水现象。