怀孕45天时孕囊是在宫腔之内。
孕囊一般是位于宫腔的，女性朋友在怀孕35到40天左右，就可以通过B超检查看到孕囊了。同时女性的子宫和卵巢并不是直接连接在一起的，因此与卵巢没有任何的关系。但如果出现孕囊位置过低，并伴有出血的情况，则需要住院进行保胎治疗，并且要在医生的指导下进行口服或者注射药物来进行保胎治疗。