怀孕3个月后自然流产可以在医生指导下口服消炎药物或促进子宫恢复的药物，具体如下：
可以口服益母草颗粒促进子宫收缩，帮助子宫内排出淤血。流产后要到医院复查B超，看还有没有残留物在子宫内，若有残留物应进行清宫治疗。建议适当按摩小腹帮助子宫收缩，有利于子宫恢复。可以多吃水果、蔬菜补充维生素，可以提高身体抵抗力，有利于身体恢复。