服用甲硝唑后查出怀孕，要对甲硝唑的服用时间、受孕后3周内用药情况、是否完全或不产生影响进行分析，即若胚胎受影响则有自然流产的危险，若妊娠持续存在则说明用药效果不大。
如怀孕后3～8周内用药，则为胚胎畸形敏感期。若所用药物剂量较大，则影响作用更为显着，因此应通过B超监测胎龄，并与给药时间相关性分析判断，猜测胚胎受影响程度或有无不良影响，随后需做好定期检查工作。