孩子脑积水病因导致小孩脑积水有很多因素，主要表现在脑脊液分泌，小儿脑积液分泌量过多，可导致脑袋积水，小孩再发育时，侧脑室脑脉络丛严重增生，造成脑脊液分泌过多。另外一个因素就是由于血液中含有一些有害物质如蛋白质、胆固醇等成分而产生的沉淀，这些物质进入到大脑内影响了孩子正常的血液循环，从而使得脑部供血不足出现症状。脑脊液分泌量过多，脑积液的吸收功能亦存在障碍，可使脑积水加重，儿童脑脊液循环通道障碍，亦为脑积液之诱因，先天发育阻碍脑脊液循环障碍，例如，孕妇孕期发烧或吃避孕药，均可导致小儿发育不良。