怀孕六周时，甲减是否会影响胎儿需要根据患者自身情况以及甲状腺功能情况以及胎儿自身在子宫内发育的情况进行综合判断。甲减有可能会影响胎儿，也有可能不会对胎儿造成影响。甲减患者要更重视甲状腺功能的检测，这样可以保证在孕期之内，甲状腺功能持续的波动于妊娠所要求的范围之内。建议孕妇进行产检和与甲状腺相关的检查，由医生根据检查结果具体的评判胎儿是否会受到影响。