怀孕40天时流产可以选择药流或人流。药流或人流以后是否需要清宫，主要取决于复查结果是否提示有残留。一般情况下，在流产以后一周左右需要做B超，观察患者宫腔内的情况。如果内膜线不完整而且有实质性的残留伴有丰富的血流信号，需要安排清宫手术。如果宫腔内膜线完整，没有实质性的残留，则不需要清宫。建议同房时做好避孕措施，避免意外怀孕。