怀孕了有肾结石有以下办法止疼，具体分析如下：
怀孕时如果发生肾结石，当结石排入输尿管后，会有严重的腰腹部疼痛，也就是肾绞痛，这种情况会导致流产，所以要进行一些积极的治疗，比如服用一些药物，比如服用黄体酮，可以减轻输尿管痉挛，减轻痛苦，同时服用黄体酮也能起到保护胎的效果。在孕酮治疗不理想的情况下，可以采用经输尿管镜下的输尿管植入术，能立即减轻痛苦。