怀孕36天有褐色分泌物可能是生理性原因引起的，也可能是病理性原因引起的。
女性在孕36天出现棕色的分泌物，需要考虑有先兆的流产症状，也有可能是因为胎儿出现了异常情况。因此检查血液中的绒毛膜促性腺激素来判断是否有怀孕的转归。做妇科检查，检查有无葡萄糖、有无宫内怀孕、有无异位怀孕、胎儿的体积、生存状况等。另外还要进行孕酮雌二醇的全面检查，同时还要定期去医院做妇科检测，看看有没有怀孕的情况。