怀孕霉菌性阴炎可能是生理性原因引起的，也可能是病理性原因引起的。
妊娠中出现霉菌性阴道炎的主要原因，是受到白假丝酵母菌的影响。怀孕时，由于体内的性荷尔蒙分泌增高，会引起阴道上皮中糖原的增多，从而引起阴道的酸性。同时，肾脏中的血糖会下降，尿中的糖分也会增加，从而导致假丝酵母的生长和增殖。霉菌性阴道炎有一定的原因，比如免疫力降低、某些疾病、维生素B缺乏等。