怀孕了有囊肿是不需要处理的，定期复查，暂时观察就可以，因为整个孕期如果说囊肿特别大，引起了一些激发的症状，引起一些肚疼甚至破裂，导致了感染，肯定就是权衡利弊，有可能就是因为这个囊肿激发的并发症比较重，有可能会终止妊娠，做一个流产。