做试管婴儿移植囊胚是有宫外孕可能的。目前医学做试管婴儿是没有办法避免宫外孕发生的。女性把囊胚植入女性的子宫腔之后，囊胚可以在女性体内自由的活动，寻找一个适合自己居住的场所，子宫腔与输卵管是相通的，不排除囊胚可能就跑到了输卵管内着床，宫外孕就这样发生了。