怀孕40天左右做B超检查会看到孕囊的，如果在宫内看不到孕囊，宫外有包块出现，可能是宫外孕的。及时地进行手术治疗，不会有太大的后遗症，最严重的是切除一侧输卵管之后，影响以后怀孕概率，现在的疼痛可能是其他原因引起的，需要做个妇科B超检查看看先。