孕囊的形状取决于其张力和可伸缩的空间。如果母亲的子宫相对标准，则大部分孕囊是圆形或者是椭圆形的。如果母亲的子宫不是标准的，或者是子宫中有子宫肌瘤，当孕囊被植入时，形状就会发生改变。母亲的孕囊与胎儿的形状没有关系，一般发育良好的孕囊是圆形的，但有时孕囊会随着子宫腔的形状而生长。妊娠囊的形状是由其张力和羊水量决定的，并会自行的发生形状改变。怀孕天数不同，孕囊的形状也是不同的。