畸形精子症是由生殖道感染引起者，可进行抗炎治疗，由内分泌异常所致者，则给予内分泌功能调整，应考虑手术治疗。畸形精子症的治疗高畸形率精子症所致不育症应根据引起畸形精子的原因，消除不利因素(药物、放射线、高温、酒等)，针对病因进行治疗。畸形精子如超过70，应进行染色体检查。