阴茎短小是一种较普通的先天性异常，阴茎长度比同龄人小2个标准差（cm）。此病与体内睾丸酮缺乏有关，睾丸酮缺乏是激素靶器官发育不良的结果。常伴有睾丸发育差，下降不全。另外一些器官发育（包括阴囊）也可受累。下丘脑分泌的黄体生成素释放激素（LHRH）减少。阴茎短小者影响正常夫妻生活，丧失正常生育能力。