肾结石若长时间没有排出体外，滞留于肾中，就会给人体带来一定程度的危害。其影响程度，需结合结石大小，多少和部位进行判断。
肾脏中较细小之结石如肾盏中直径小于5mm之结石基本上对于尿液之生成，排泄过程，并无太大影响。对于较大的结石，特别是直径在1-2cm以上的结石，可能引起梗阻，影响局部尿的排出，导致肾积水，长期下去可能会影响肾功能。
如果结石在肾盂内，或在肾和输尿管的连接部内，不管是大的还是小的，都要注意，因为这时结石易阻塞肾脏，阻塞后可使整个肾脏积水而影响机体的正常肾功能。结石反复激发，易造成肾内感染、诱发肾盂肾炎复发，也有可能出现恶性肿瘤。
总之，对肾盏中较小结石主要采取保守治疗，病人要注意多喝水，多活动，以免结石继续增多和生长，必要时应借助药物，使结石得以排出；对较大结石，若病人相对体质良好则提倡外科治疗。因而，患者应尽早到医院检查，规矩检查结果，征求医生意见，早日进行相关的治疗。