对于长时间勃起后的疼痛，可以通过休息、手术等方式来处理。
1、休息：轻微的痛，在阴茎乏力的时候，可以休息一下，勃起疼痛的症状就会有所改善，不用太过担心。
2、手术：若阴茎持续勃起时间长达6个小时以上，应尽快就医，若时间长了，可能会造成阴茎海绵体的血液循环受阻，造成阳萎等性功能障碍，仅靠止痛是无法改善勃起的，应尽快到专业医院进行药物注射、手术分流术、口服止痛药等。在阴茎疼痛没有完全消失之前，最好不要手淫，也不要同房。
当海绵体充血时，会对尿道平滑肌产生压迫，从而导致阴茎勃起。海绵体充血过长，可能会导致平滑肌受压损伤，出现阴茎疼痛。如果阴茎压迫比较严重，还会出现尿道内出血。
所以对于阴茎勃起的疼痛，一定要引起足够的重视，一旦出现任何不舒服的地方，一定要及时去医院治疗。