尿尿时小肚子疼可能是由于多种原因引起的，包括：
1.膀胱炎：由于细菌感染引起的膀胱炎症，可能导致排尿疼痛、尿急、尿频等症状。治疗方法包括用药和遵医嘱。
2.尿道炎：由于细菌感染引起的尿道炎症，可能导致排尿疼痛、尿急等症状。治疗方法包括盐酸米诺环素胶囊、氨苄西林丙磺舒分散片等药进行治疗。
3.膀胱结石：膀胱结石是由尿液中的矿物质所形成的小而坚硬的结晶。它们可能阻塞尿道或膀胱出口，导致排尿困难或疼痛。治疗方法包括手术治疗。
如果尿尿时小肚子疼持续或加重，建议及时就医，明确病因，对症治疗。