临床上检查精液常规发现精子异常，可以有精子的畸形率增高，前向运动精子率减少，或者是精浆抗原，染色体异常等情况。遇到这类情况往往要判断精子的异常是由于染色体遗传因素引起的原发疾病还是由于精索静脉曲张，睾丸炎，附睾炎，前列腺炎等引起的继发疾病。因此可以通过医生的体检，影像学检查，性激素水平检查以及染色体方面的检查来判断精子异常是由于什么原因引起的，比如染色体异常，激素水平异常，输精管梗阻，炎症等原因。