睾丸有囊肿一般是不会影响怀孕的。因为睾丸囊肿是睾丸上的囊肿病变，如果睾丸囊肿较小，患者不会出现任何症状，睾丸囊肿对精液的产生和精液的排出过程都不会造成影响，这种情况下不会影响怀孕。如果出现睾丸囊肿害怕影响怀孕的话，患者可以到医院查精液常规。如果精液常规正常，那肯定是不会影响怀孕。对于较大的睾丸囊肿，如睾丸囊肿大于2cm，导致患侧阴囊出现坠胀不适，可以通过手术治疗切除睾丸囊肿。