肾结石肾积水手术是有一定的风险的。虽然目前肾结石肾积水手术都是微创手术，但是再小的手术也是有一定的风险的。所以手术前要评估患者一般的状态、心肺功能、能否难受手术和麻醉，以及存在原发疾病（高血压、糖尿病）的控制情况。肾结石肾积水手术中存在麻醉风险，术后有出血或者是感染的风险，还有存在结石残留和结石复发、肾积水不改善或加重的风险。