精子畸形率高如果成功怀孕了，对胚胎的发育可能会有影响。精子畸形率升高可能存在精子染色体基因的异常，受孕后可能会有流产现象发生。精子畸形率高包括了头部畸形、体部畸形、尾部畸形的比例升高，这样可能存在头部顶体酶活性异常、尾部运动障碍，最终导致成功受孕的概率降低，尤其是当精子畸形率大于96%时，这也称为畸形精子症。