早泄除了行为疗法以外，药物治疗是首选治疗。药物治疗的首选药物是选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，目前常用的5-羟色胺再摄取抑制剂包括达泊西汀、舍曲林、帕罗西汀、氟西汀、西酞普兰、氟伏沙明等，其它的还有氯米帕明。达泊西汀是第一个也是唯一一个被批准用于治疗早泄的药物，是一种强效的选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，即起效快、快速吸收、半衰期短，在体内迅速清除、避免积累，对原发性和继发性的早泄具有相似的疗效。
其它关于早泄治疗的药物是局部麻醉药物，局部麻醉药物是最早用于早泄药物治疗的方法，由于可以降低阴茎敏感性、延长射精潜伏期，而且不会对射精感觉造成影响，从而用于早泄的治疗，目前常用的是利多卡因、丙胺卡因乳膏，其它的还有中成药制剂。
关于治疗阳痿的5型磷酸二酯酶抑制剂，也有报道应用于早泄的治疗，因此对于合并阳痿的早泄患者可以采用5型磷酸二酯酶抑制剂或者与其它药物联合应用。其它的药物包括α1肾上腺素能受体拮抗剂，如特拉唑嗪、阿夫唑嗪、曲马多等药物。