阴茎水肿是由不同的原因所造成，所以想要消除，先要找到病因再进行治疗，具体如下：
第一、最常见的水肿原因是由于嵌顿包茎所致，也就是包皮上翻时没有及时翻回而出现嵌顿，淋巴回流障碍而造成包皮严重的水肿。这种情况应该迅速将包皮翻回原位，水肿会慢慢消失。但是如果出现包皮发红、发紫，甚至出现破溃，就要及时到医院请医生帮助，将嵌顿包茎复位，必要时可以进行手术治疗。
第二、由于感染所致，感染的时候由于细菌影响，而导致水肿、红肿、疼痛、分泌物增多等等情况，建议局部进行清洗，可以口服抗菌素、局部外涂抗生素药膏。如果是霉菌所致，可以应用抗霉菌的药膏外涂。
第三、见于全身性水肿，由于会阴部位皮肤松弛，因此往往是全身性水肿的一部分，例如低蛋白血症、淋巴回流障碍、低钠血症、营养不良，以及肿瘤晚期出现的恶液质等等，也都可以造成会阴部的水肿，就要治疗原发病，单纯消除水肿没有意义。
第四、见于过敏的情况，比如食物、药物、针织物品等等过敏，会出现阴茎水肿的反应，可以应用抗过敏药物来消除阴茎水肿。