睾丸发育不良的治疗关键是明确诊断，找到病因，针对性治疗原发疾病，主要通过药物进行治疗，发生男性女性化者可根据需求行乳房成形术。
一、药物治疗
性激素：主要适用于由于内分泌异常导致的睾丸发育不全，经过雄激素治疗后，可以解决男性女性化的问题，但不可解决生育问题。
二、手术治疗
乳房成形术：主要适用于男性女性化症状明显，乳房显著发育的患者，通过手术治疗乳房问题。