肾周脓肿一般通过2~3周的治疗症状即可缓解，常见的治疗方式有药物治疗、手术治疗、穿刺引流等，常见的抗生素有头孢哌酮舒巴坦、环丙沙星、头孢唑林等。
一、药物治疗
抗生素治疗：一般选用针对大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌以及变形杆菌敏感的抗生素。在培养结果出来之前，可以经验性的选择抗生素，常见的抗生素有头孢哌酮舒巴坦、环丙沙星、左氧氟沙星、头孢唑林，抗生素至少需要使用2~3周。
二、手术治疗
当内科治疗无效时，机体合并肾结石梗阻、膀胱输尿管反流等泌尿系统基础疾病，可以进行手术治疗引流脓肿，如果手术发现肾脏萎缩、肾脏失去功能，可以考虑行肾切除术。
三、其他治疗
穿刺引流：当抗生素治疗无效时，肾周脓肿巨大导致肾脏失去功能，可以在肾脏超声或者CT的引导下进行穿刺引流脓液。一般疗效比较好，脓液引流后全身症状即可得到改善。