慢性附睾炎的治疗主要包括一般治疗、内科药物治疗以及外科手术治疗等。若能明确引起附睾炎的病因，应针对病因进行治疗。慢性附睾炎并发前列腺炎、精囊炎时，应积极治疗并发症。
一、一般治疗
1、卧床休息：附睾炎急性期应卧床休息，阴囊用人工托可减轻疼痛。
2、冰敷：早期可将冰袋放在附睾处，防止肿胀。
3、热敷：晚期可用热敷加速炎症消退，减轻病人不适。
二、药物治疗
1、复方新诺明：伴有细菌性前列腺炎者，可每天口服复方新诺明。
2、抗生素：若局部红肿明显，血白细胞增多，体温升高，应静脉滴入抗生素，直至体温正常，改口服抗生素。
3、利多卡因：如附睾疼痛较重可用1%的利多卡因由睾丸上端精索行局部注射以减轻疼痛。
三、手术治疗
若抗生素治疗无效，疑有睾丸缺血时，应行附睾切开减压，纵行或横行切开附睾脏层鞘膜，但要避免伤及附睾管。
四、中医治疗
1、慢性附睾炎属于中医中的“子痈、瘕积、淋证"范畴。病机与肝、肾二经密切相关，与阴部不洁、外染湿热秽毒、精神紧张、过食肥甘厚腻等不良生活习惯相关。
2、肝经淤血、气滞血瘀、湿热余邪为本病主要病机，因此，主要用疏肝通络、行气活血散结的组方治疗慢性附睾炎。
3、对于病因未明的慢性附睾炎，中医治疗有明显的优势。目前临床上慢性附睾炎往往会辅以一些中成药进行治疗。