输尿管损伤的临床表现取决于发现时间、单侧或双侧损伤、感染存在与否，及尿瘘发生的时间及部位，可有腰痛、尿外渗、尿道流血、疼痛、局部压痛、排尿困难及尿潴留、排尿疼痛、瘀斑、腹膜刺激征、尿瘘等症状。
1、尿瘘及尿外渗：如果术中未及时发现输尿管被切断或切开，可在出现损伤后即时或数天内甚至数周内出现伤口漏尿、腹腔积尿、阴道漏尿或尿液囊肿。
2、无尿：若双侧输尿管损伤，尤其是双侧输尿管被结扎或断裂会产生无尿。应与急性肾功能衰竭引起的无尿鉴别。
3、血尿：外伤引起的输尿管损伤90%会出现血尿，而医源性损伤仅11%的病例出现血尿。一旦出现血尿，则应高度怀疑输尿管损伤；而未出现血尿也并不能排除输尿管的损伤。
4、腰痛：由输尿管损伤造成的梗阻会使肾脏及输尿管近段积水，可继发肾脏感染甚至肾功能损伤，临床表现为腰痛。
5、感染症状：有尿瘘或尿外渗时可引起继发感染。若局限于腹膜后间隙，则表现为体温增高、小便刺痛、腰部压痛等全身和局部症状。若尿液漏入腹腔，则出现腹胀、腹痛等腹膜炎症状。