泌尿系生殖系支原体感染的症状主要有尿频、尿急、尿痛，尿道有分泌物或脓性分泌物，也常出现会阴部胀痛、腰酸、双股内侧不适感或在做提肛动作时有自会阴向股内侧发散的刺痛感。
1、非淋菌性尿道炎：尿道外口红肿，沿尿道可有压痛、尿急、尿频、尿道烧灼感、尿痛、排尿困难和尿道出现分泌物。
2、盆腔炎：出现下腹疼痛、下腹紧张，压痛明显，恶寒、发热，血白细胞数增加。
3、阴道炎与宫颈炎：阴道分泌物增多，外阴瘙痒，阴道与宫颈黏膜充血。
4、孕妇支原体病：子宫炎、不孕、自发性流产，胎儿死亡等。
5、膀胱炎：患者可出现膀胱刺激征，即尿频、尿急、尿痛，肉眼还可观察到血尿，会阴、耻骨上区均会出现疼痛。
6、急性肾盂肾炎：患者起病急，可出现发热、腰痛的典型症状，还可出现尿急、尿频、尿痛症状。
7、慢性肾盂肾炎：病情反复发作，可间歇性出现腰痛，多数患者出现尿多、夜尿表现，也可出现尿路刺激征。