小便的时候出现阴茎疼痛，可能是因为有尿道炎导致的，为了缓解这种疼痛需要积极的消炎治疗。建议可以上医院做尿道分泌物检测，小便常规检查，有助于明确病情。通过分泌物检测，确定为淋菌性尿道炎的时候，建议可以用头孢曲松，银花泌炎宁颗粒缓解疼痛。确定为非淋菌性尿道炎的情况下，建议可以用阿奇霉素消炎治疗，一般等炎症控制住，疼痛症状可以缓解。